Installation d'apt-get, répertoire de chemin et programmes de dépendance en cours d'exécution
Je suis très nouveau sur Ubuntu et je vous prie de supporter si je présente une version très laïque de l'explication.
Mon système d'exploitation: serveur Ubuntu 11.10, version 64 bits
Je dois utiliser trois outils samtools, bowtie et tophat. Cependant, tophat dépend des outils et du nœud papillon. Le facteur de dépendance est - pour déterminer où se trouve exactement le chemin d'accès aux deux outils ci-dessus (samtools et nœud papillon).
Maintenant, je peux installer samtools et bowtie en utilisant Sudo apt-get install cependant
- Je ne sais pas exactement où se trouvent les chemins de bibliothèque pour samtools ou bowtie
- Selon les notes d'installation de tophat, je dois extraire l'outil du fichier compressé, changer le répertoire dans ce fichier et le fichier ./configure; MAIS je ne vois pas le script ./configure dans le répertoire extrait
Samtools et Bowtie et Tophat se trouvent sur leurs sites, il s'agit de la méthode d'installation j'essaie de suivre.
Pour savoir où les bibliothèques sont installées, vous pouvez essayer dpkg -L samtools et la même chose pour bowtie