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PATH, suppression des anciennes versions de usr / bin

Je suis nouveau sur Ubuntu. J'ai hérité d'un ordinateur d'une autre personne. Elle a installé de nombreux petits programmes de bioinformatique dans le dossier racine et /usr/local/bin.

Je dois pouvoir supprimer les anciennes versions car elles interfèrent avec la nouvelle version ou bien, même si j'essaie d'exécuter la version la plus récente en utilisant le chemin complet de leur commande, et/ou d'inclure le chemin dans PATH, l'ancien la version sera utilisée.

J'ai du mal à accéder à ces dossiers pour pouvoir supprimer des fichiers. Ou bien la suppression de fichiers individuels ne ferait-elle qu'aggraver les problèmes? La plupart de ces outils ne sont pas disponibles dans le Centre logiciel ou apt-get.

Tout ce que je peux faire en plus de formater tout le disque et de repartir à zéro?

J'ai également des problèmes similaires avec les bibliothèques partagées pour Perl, Bioperl, Python, etc. Ils ne peuvent pas être trouvés, ils ne peuvent pas être mis à jour, etc. Je sais que ce n'est pas vraiment une question Ubuntu, donc même une redirection vers une meilleure source de réponses serait appréciée (livres ou sites Web).

command-linedependencieslibrariesperl
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Susanne

Si vous souhaitez supprimer les programmes installés sur le dossier/racine, je vous recommande simplement de supprimer tout sous-dossier lié à ces applications. Par exemple, si vous avez un programme appelé 'biolis' installé dans/root/biolis, faites simplement:

Sudo rm -r /root/biolis

Je viens de vérifier ma propre installation Ubuntu et dans le dossier/usr/local/bin, je n'ai que des programmes à installer manuellement. Vous pouvez donc utiliser la même procédure ci-dessus.

Sudo rm -r /usr/local/bin/biolis2

J'espère que cela fonctionne pour vous.

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Philippe Delteil

Dans des situations comme la vôtre, il est souvent facile et rapide d'installer une nouvelle version de la saveur de la communauté Ubuntu ou Ubuntu (Kubuntu, Lubuntu, ... Xubuntu).

Avant l'installation, essayez le en direct (démarré à partir d'un disque DVD ou d'une clé USB) ,

Cela nous aidera à vous aider si vous nous donnez des détails sur l'ordinateur

  • Nom de marque et modèle
  • CPU
  • RAM (taille)
  • lecteur interne (taille)
  • puce graphique/carte
  • puce/carte wifi

(Vous pouvez modifier votre question pour ajouter cette information.)

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sudodus