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Obtenir des données JSON importées dans un cadre de données

J'ai un fichier contenant plus de 1500 objets JSON que je veux utiliser dans R. J'ai été en mesure d'importer les données sous forme de liste, mais je ne parviens pas à le forcer dans une structure utile. Je veux créer un cadre de données contenant une ligne pour chaque objet JSON et une colonne pour chaque paire clé: valeur.

J'ai recréé ma situation avec ce petit jeu de données factice:

[{"name":"Doe, John","group":"Red","age (y)":24,"height (cm)":182,"wieght (kg)":74.8,"score":null},
{"name":"Doe, Jane","group":"Green","age (y)":30,"height (cm)":170,"wieght (kg)":70.1,"score":500},
{"name":"Smith, Joan","group":"Yellow","age (y)":41,"height (cm)":169,"wieght (kg)":60,"score":null},
{"name":"Brown, Sam","group":"Green","age (y)":22,"height (cm)":183,"wieght (kg)":75,"score":865},
{"name":"Jones, Larry","group":"Green","age (y)":31,"height (cm)":178,"wieght (kg)":83.9,"score":221},
{"name":"Murray, Seth","group":"Red","age (y)":35,"height (cm)":172,"wieght (kg)":76.2,"score":413},
{"name":"Doe, Jane","group":"Yellow","age (y)":22,"height (cm)":164,"wieght (kg)":68,"score":902}]

Quelques caractéristiques des données:

  • Les objets contiennent tous le même nombre de paires clé: valeur bien que certaines valeurs soient nulles
  • Il y a deux colonnes non numériques par objet (nom et groupe)
  • nom est l'identifiant unique, il y a une dizaine de groupes
  • la plupart des entrées de nom et de groupe contiennent des espaces, des virgules et autres signes de ponctuation.

Sur la base de cette question: liste R (structure (list ())) en trame de données , j'ai essayé les solutions suivantes:

json_file <- "test.json"
json_data <- fromJSON(json_file)
asFrame <- do.call("rbind.fill", lapply(json_data, as.data.frame))

Avec mes données réelles et ces données fausses, la dernière ligne me donne cette erreur:

Error in data.frame(name = "Doe, John", group = "Red", `age (y)` = 24,  : 
  arguments imply differing number of rows: 1, 0
jsonrimportdataframe
47
Andrew Staroscik

Il vous suffit de remplacer vos NULL par des NA:

require(RJSONIO)    

json_file <-  '[{"name":"Doe, John","group":"Red","age (y)":24,"height (cm)":182,"wieght (kg)":74.8,"score":null},
    {"name":"Doe, Jane","group":"Green","age (y)":30,"height (cm)":170,"wieght (kg)":70.1,"score":500},
    {"name":"Smith, Joan","group":"Yellow","age (y)":41,"height (cm)":169,"wieght (kg)":60,"score":null},
    {"name":"Brown, Sam","group":"Green","age (y)":22,"height (cm)":183,"wieght (kg)":75,"score":865},
    {"name":"Jones, Larry","group":"Green","age (y)":31,"height (cm)":178,"wieght (kg)":83.9,"score":221},
    {"name":"Murray, Seth","group":"Red","age (y)":35,"height (cm)":172,"wieght (kg)":76.2,"score":413},
    {"name":"Doe, Jane","group":"Yellow","age (y)":22,"height (cm)":164,"wieght (kg)":68,"score":902}]'


json_file <- fromJSON(json_file)

json_file <- lapply(json_file, function(x) {
  x[sapply(x, is.null)] <- NA
  unlist(x)
})

Une fois que vous avez une valeur non nulle pour chaque élément, vous pouvez appeler rbind sans obtenir d'erreur:

do.call("rbind", json_file)
     name           group    age (y) height (cm) wieght (kg) score
[1,] "Doe, John"    "Red"    "24"    "182"       "74.8"      NA   
[2,] "Doe, Jane"    "Green"  "30"    "170"       "70.1"      "500"
[3,] "Smith, Joan"  "Yellow" "41"    "169"       "60"        NA   
[4,] "Brown, Sam"   "Green"  "22"    "183"       "75"        "865"
[5,] "Jones, Larry" "Green"  "31"    "178"       "83.9"      "221"
[6,] "Murray, Seth" "Red"    "35"    "172"       "76.2"      "413"
[7,] "Doe, Jane"    "Yellow" "22"    "164"       "68"        "902"
54
SchaunW

Ceci est très simple si vous utilisez library(jsonlite) et la fonction fromJSON. Il gère également les valeurs null et les convertit en NA.

json_file <-  '[{"name":"Doe, John","group":"Red","age (y)":24,"height (cm)":182,"wieght (kg)":74.8,"score":null},
    {"name":"Doe, Jane","group":"Green","age (y)":30,"height (cm)":170,"wieght (kg)":70.1,"score":500},
{"name":"Smith, Joan","group":"Yellow","age (y)":41,"height (cm)":169,"wieght (kg)":60,"score":null},
{"name":"Brown, Sam","group":"Green","age (y)":22,"height (cm)":183,"wieght (kg)":75,"score":865},
{"name":"Jones, Larry","group":"Green","age (y)":31,"height (cm)":178,"wieght (kg)":83.9,"score":221},
{"name":"Murray, Seth","group":"Red","age (y)":35,"height (cm)":172,"wieght (kg)":76.2,"score":413},
{"name":"Doe, Jane","group":"Yellow","age (y)":22,"height (cm)":164,"wieght (kg)":68,"score":902}]'

library(jsonlite)
fromJSON(json_file)
#           name  group age (y) height (cm) wieght (kg) score
# 1    Doe, John    Red      24         182        74.8    NA
# 2    Doe, Jane  Green      30         170        70.1   500
# 3  Smith, Joan Yellow      41         169        60.0    NA
# 4   Brown, Sam  Green      22         183        75.0   865
# 5 Jones, Larry  Green      31         178        83.9   221
# 6 Murray, Seth    Red      35         172        76.2   413
# 7    Doe, Jane Yellow      22         164        68.0   902

str(fromJSON(json_file))
# 'data.frame': 7 obs. of  6 variables:
# $ name       : chr  "Doe, John" "Doe, Jane" "Smith, Joan" "Brown, Sam" ...
# $ group      : chr  "Red" "Green" "Yellow" "Green" ...
# $ age (y)    : int  24 30 41 22 31 35 22
# $ height (cm): int  182 170 169 183 178 172 164
# $ wieght (kg): num  74.8 70.1 60 75 83.9 76.2 68
# $ score      : int  NA 500 NA 865 221 413 902
28
SymbolixAU

Pour supprimer les valeurs NULL, utilisez le paramètre nullValue

json_data <- fromJSON(json_file, nullValue = NA)
asFrame <- do.call("rbind.fill", lapply(json_data, as.data.frame))

de cette façon, il n'y aura pas de citations inutiles dans votre sortie

2
lenoch
library(rjson)
Lines <- readLines("Yelp_academic_dataset_business.json") 
business <- as.data.frame(t(sapply(Lines, fromJSON)))

Vous pouvez essayer ceci pour charger des données JSON dans R

1
Ahsan Habib
dplyr::bind_rows(fromJSON(file_name))
0
YH Wu