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Interpolation sur DataFrame dans pandas

J'ai un DataFrame, disons une surface de volatilité avec un index comme heure et une colonne comme frappe. Comment faire une interpolation bidimensionnelle? Je peux reindex mais comment gérer NaN? Je sais que nous pouvons fillna(method='pad') mais ce n'est même pas une interpolation linéaire. Existe-t-il un moyen de brancher notre propre méthode pour effectuer une interpolation?

30
archlight

Vous pouvez utiliser DataFrame.interpolate pour obtenir une interpolation linéaire.

In : df = pandas.DataFrame(numpy.random.randn(5,3), index=['a','c','d','e','g'])

In : df
Out:
          0         1         2
a -1.987879 -2.028572  0.024493
c  2.092605 -1.429537  0.204811
d  0.767215  1.077814  0.565666
e -1.027733  1.330702 -0.490780
g -1.632493  0.938456  0.492695

In : df2 = df.reindex(['a','b','c','d','e','f','g'])

In : df2
Out:
          0         1         2
a -1.987879 -2.028572  0.024493
b       NaN       NaN       NaN
c  2.092605 -1.429537  0.204811
d  0.767215  1.077814  0.565666
e -1.027733  1.330702 -0.490780
f       NaN       NaN       NaN
g -1.632493  0.938456  0.492695

In : df2.interpolate()
Out:
          0         1         2
a -1.987879 -2.028572  0.024493
b  0.052363 -1.729055  0.114652
c  2.092605 -1.429537  0.204811
d  0.767215  1.077814  0.565666
e -1.027733  1.330702 -0.490780
f -1.330113  1.134579  0.000958
g -1.632493  0.938456  0.492695

Pour tout ce qui est plus complexe, vous devez déployer votre propre fonction qui traitera un objet Series et remplira les valeurs NaN à votre guise et renverra un autre objet Series.

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Avaris

Ancien thread mais pensais que je partagerais ma solution avec l'extrapolation/interpolation 2D, en respectant les valeurs d'index, qui fonctionne également à la demande. Le code s'est révélé un peu bizarre, alors faites-moi savoir s'il existe une meilleure solution:

import pandas
from   numpy import nan
import numpy

dataGrid = pandas.DataFrame({1: {1: 1, 3: 2},
                             2: {1: 3, 3: 4}})


def getExtrapolatedInterpolatedValue(x, y):
    global dataGrid
    if x not in dataGrid.index:
        dataGrid.ix[x] = nan
        dataGrid = dataGrid.sort()
        dataGrid = dataGrid.interpolate(method='index', axis=0).ffill(axis=0).bfill(axis=0)

    if y not in dataGrid.columns.values:
        dataGrid = dataGrid.reindex(columns=numpy.append(dataGrid.columns.values, y))
        dataGrid = dataGrid.sort_index(axis=1)
        dataGrid = dataGrid.interpolate(method='index', axis=1).ffill(axis=1).bfill(axis=1)

    return dataGrid[y][x]


print getExtrapolatedInterpolatedValue(2, 1.4)
>>2.3
6
Nick Holden