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Ouvrez le fichier .h5 dans Python

J'essaie de lire un fichier h5 en Python.

Le fichier se trouve dans ce lien et il s'appelle 'vstoxx_data_31032014.h5'. Le code que j'essaie d'exécuter provient du livre Python for Finance, par Yves Hilpisch et se présente comme suit:

import pandas as pd     
h5 = pd.HDFStore('path.../vstoxx_data_31032014.h5', 'r')
futures_data = h5['futures_data']  # VSTOXX futures data
options_data = h5['options_data']  # VSTOXX call option data
h5.close()

Je reçois l'erreur suivante:

h5 = pd.HDFStore('path.../vstoxx_data_31032014.h5', 'r')
Traceback (most recent call last):

  File "<ipython-input-692-dc4e79ec8f8b>", line 1, in <module>
    h5 = pd.HDFStore('path.../vstoxx_data_31032014.h5', 'r')

  File "C:\Users\Laura\Anaconda3\lib\site-packages\pandas\io\pytables.py", line 466, in __init__
    self.open(mode=mode, **kwargs)

  File "C:\Users\Laura\Anaconda3\lib\site-packages\pandas\io\pytables.py", line 637, in open
    raise IOError(str(e))

OSError: HDF5 error back trace

  File "C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5F.c", line 604, in H5Fopen
    unable to open file
  File "C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5Fint.c", line 1085, in H5F_open
    unable to read superblock
  File "C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5Fsuper.c", line 277, in H5F_super_read
    file signature not found

End of HDF5 error back trace

Unable to open/create file 'path.../vstoxx_data_31032014.h5'

où j'ai substitué mon répertoire de travail par 'chemin ... /' aux fins de cette question.

Est-ce que quelqu'un sait d'où cette erreur pourrait provenir?

pythonpandash5py
7
python_enthusiast

Pour ouvrir un fichier HDF5 avec le module h5py, Vous pouvez utiliser h5py.File(filename). La documentation peut être trouvée ici .

import h5py

filename = "vstoxx_data_31032014.h5"

h5 = h5py.File(filename,'r')

futures_data = h5['futures_data']  # VSTOXX futures data
options_data = h5['options_data']  # VSTOXX call option data

h5.close()
5
DavidG