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Création d'une matrice symétrique dans R

J'ai une matrice dans R qui est censée être symétrique, cependant, en raison de la précision de la machine, la matrice n'est jamais symétrique (les valeurs diffèrent d'environ 10 ^ -16). Depuis que je sais que la matrice est symétrique, je l'ai fait jusqu'à présent pour contourner le problème:

s.diag = diag(s)
s[lower.tri(s,diag=T)] = 0
s = s + t(s) + diag(s.diag,S)

Existe-t-il une meilleure commande en ligne pour cela?

rsymmetric
27
user2005253

La solution de contournement est-elle vraiment nécessaire si les valeurs ne diffèrent que par autant?

Quelqu'un a souligné que ma réponse précédente était fausse. J'aime mieux les autres, mais comme je ne peux pas supprimer celui-ci (accepté par un utilisateur qui est parti), voici une autre solution utilisant le package micEcon:

symMatrix(s[upper.tri(s, TRUE)], nrow=nrow(s), byrow=TRUE)
10
Peyton
s<-matrix(1:25,5)
s[lower.tri(s)] = t(s)[lower.tri(s)]
52
user3318600

Vous pouvez forcer la matrice à être symétrique en utilisant la fonction forceSymmetric dans le package Matrix dans R:

library(Matrix)
x<-Matrix(rnorm(9), 3)
> x
3 x 3 Matrix of class "dgeMatrix"
           [,1]       [,2]       [,3]
[1,] -1.3484514 -0.4460452 -0.2828216
[2,]  0.7076883 -1.0411563  0.4324291
[3,] -0.4108909 -0.3292247 -0.3076071

A <- forceSymmetric(x)
> A
3 x 3 Matrix of class "dsyMatrix"
           [,1]       [,2]       [,3]
[1,] -1.3484514 -0.4460452 -0.2828216
[2,] -0.4460452 -1.0411563  0.4324291
[3,] -0.2828216  0.4324291 -0.3076071
13
Metrics
 s<-matrix(1:25,5)
 pmean <- function(x,y) (x+y)/2
 s[] <- pmean(s, matrix(s, nrow(s), byrow=TRUE))
 s
#-------
     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]    1    4    7   10   13
[2,]    4    7   10   13   16
[3,]    7   10   13   16   19
[4,]   10   13   16   19   22
[5,]   13   16   19   22   25
8
42-