Problème d'installation de rgdal

Question

Je veux installer rgdal pour "R version 3.2.3 (2015-12-10)". J'ai téléchargé et installé

GDAL 1.11 terminé
Framework PROJ v4.9.2-2
Cadre GEOS v3.5.0-1

Ensuite, dans RStudio, j'ai tapé install.packages("rgdal") ce qui m'a donné ceci:

> .... > > configure: CC: clang configure: CXX: clang++ configure: rgdal: > 1.1-1 checking for /usr/bin/svnversion... yes configure: svn revision: > 572 checking for gdal-config... > no no configure: error: gdal-config > not found or not executable. ERROR: configuration failed for package > ‘rgdal’ > * removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/rgdal’ > Warning in install.packages : installation of package ‘rgdal’ had > non-zero exit status > sessionInfo() R version 3.2.3 (2015-12-10) Platform: x86_64-Apple-darwin13.4.0 (64-bit) Running under: OS X 10.10.5 (Yosemite) locale: [1] de_AT.UTF-8/de_AT.UTF-8/de_AT.UTF-8/C/de_AT.UTF-8/de_AT.UTF-8 attached base packages: [1] stats graphics grDevices utils datasets methods base loaded via a namespace (and not attached): [1] tools_3.2.3

J'ai aussi essayé dans le terminal

R CMD INSTALL rgdal_1.1-1.tar --configure-args='--with-gdal-config=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs/gdal-config --with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers --with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'

et

Sudo R CMD INSTALL –configure-args=’–with-proj-include=/usr/local/lib’ rgdal_1.1-1.tar

Pas de chance!

Stophface · Accepted Answer

Enfin résolu.

Voici comment je l'ai fait! OS X 10.10.5 R 3.2.3 GDAL 1.1

Téléchargez et installez GDAL Complete Framework à partir de ici
Dites à votre OS X où trouver le fichier gdal-config En tapant ceci dans votre Shell echo 'export PATH=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs:$PATH' >> ~/.bash_profile Puis source ~/.bash_profile
Vérifiez si votre GDAL fonctionne correctement en tapant le bash gdalinfo --version. Cela devrait revenir avec quelque chose comme GDAL 1.11.3, released 2015/09/16.
Pour la plupart des gens, démarrer R et taper install.packages("rgdal") fonctionne (si vous avez effectué les étapes 1-3). Mais ce n'était pas le cas pour moi. Donc, passez à 5 si vous avez toujours des problèmes.
Accédez au site Web GDAL et téléchargez le fichier .tar.
Dans le shell, essayez ceci: Sudo R CMD INSTALL –configure-args=’–with-proj-include=/usr/local/lib’ rgdal_1.1-1.tar. Cela m'a quand même donné une erreur: configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations. ERROR: configuration failed for package ‘rgdal’
Donc, encore une fois, vous devez dire où trouver celui-ci. Essayez: R CMD INSTALL rgdal_1.1-1.tar --configure-args='--with-gdal-config=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs/gdal-config --with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers --with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'

Cela devrait fonctionner. Essayez en démarrant R et tapez library(rgdal).

Remarque: Avec rgoes, j'ai rencontré des problèmes similaires. This m'a aidé. Essayer:

R CMD INSTALL rgeos_0.3-15.tar --configure-args='--with-geos-config=/Library/Frameworks/GEOS.framework/unix/bin/geos-config --with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers --with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'

Pour pointer vers le fichier config. C'est ici /Library/Frameworks/GEOS.framework/unix/bin/geos-config

Fran Villamil · Answer

Note rapide s'appuyant sur la réponse précédente de @Stophface qui pourrait être utile à quelqu'un:

J'ai fait toutes les étapes énumérées ci-dessus, mais l'installation de rgdal dans Terminal m'a toujours donné l'erreur de configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations. Pourtant (et sans savoir exactement pourquoi), j'ai réussi à l'installer depuis R.app en utilisant à peu près les mêmes spécifications:

> install.packages('rgdal', type = "source", configure.args=c( '--with-gdal-config=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs/gdal-config', '--with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers', '--with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'))

Et merci encore pour votre réponse!

SymbolixAU · Answer

J'ai eu la même erreur lors de l'exécution de R 3.4.0 sur macOS Sierra (10.12). J'ai donc utilisé homebrew pour installer gdal, puis rgdal installé comme d'habitude dans R

dans le terminal

brew update brew install gdal

dans R

install.packages("rgdal")

devtools::session_info() Session info ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- setting value version R version 3.4.0 (2017-04-21) system x86_64, darwin15.6.0 ui RStudio (1.0.143) language (EN) collate en_AU.UTF-8 tz Australia/Melbourne date 2017-04-24 Packages -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- package * version date source devtools 1.12.0 2016-12-05 CRAN (R 3.4.0) digest 0.6.12 2017-01-27 CRAN (R 3.4.0) lattice 0.20-35 2017-03-25 CRAN (R 3.4.0) memoise 1.1.0 2017-04-21 CRAN (R 3.4.0) rgdal * 1.2-6 2017-04-06 CRAN (R 3.4.0) sp * 1.2-4 2016-12-22 CRAN (R 3.4.0) withr 1.0.2 2016-06-20 CRAN (R 3.4.0)

Karthik Arumugham · Answer

Je l'ai installé via conda sur mon Mac (OS X 10.10.5). L'installation a été simple. Si vous débutez avec conda, vérifiez ceci http://conda.pydata.org/docs/r-with-conda.html

conda install gdal gdalinfo --version # GDAL 2.1.0, released 2016/04/25

Installation du package R:

install.packages('rgdal', type = "source", configure.args=c( '--with-gdal-config=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs/gdal-config', '--with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers', '--with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib')) install.packages('rgeos', type = "source", configure.args=c( '--with-gdal-config=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs/gdal-config', '--with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers', '--with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib')) install.packages('maptools', dependencies=TRUE)